51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1445 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  38.48 
 
 		 392 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  35.7 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 395 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  29.9 
 
 		 395 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  30.4 
 
 		 278 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  29.32 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  27.05 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  23.47 
 
 		 394 aa  86.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  21.91 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  22.11 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.34 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 3145 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.37 
 
 		 875 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.13 
 
 		 2240 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 878 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 605 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 808 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 313 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 		 1297 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 615 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  27.66 
 
 		 765 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 792 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  36.67 
 
 		 643 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 597 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 616 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.98 
 
 		 725 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 452 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 750 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 311 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 739 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  18.85 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1245 aa  42.7  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>