More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2715 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 431 aa  870    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  70.74 
 
 		 419 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  75.68 
 
 		 415 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1076  histidyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 408 aa  338  9e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 413 aa  315  7e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 422 aa  315  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 413 aa  315  9.999999999999999e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 400 aa  309  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 422 aa  309  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 429 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43.83 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 429 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  48.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2188  histidyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 425 aa  298  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 441 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 429 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  42.68 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 422 aa  293  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 426 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 425 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 419 aa  292  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 425 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 425 aa  292  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 423 aa  290  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 448 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 413 aa  288  9e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2195  histidyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 428 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>