More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2253 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  100 
 
 		 331 aa  664    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  65.28 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  68.48 
 
 		 336 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  55.09 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  53.43 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  53.13 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  53.43 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  54.01 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  53.87 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  53.57 
 
 		 344 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  53.73 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  53.25 
 
 		 353 aa  349  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  53.59 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  56.16 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  52.54 
 
 		 360 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  53.29 
 
 		 353 aa  335  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  53.35 
 
 		 370 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  48.67 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  51.51 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  53.43 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  50.15 
 
 		 350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  48.52 
 
 		 348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  53.89 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  52.85 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  48.96 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  48.96 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  51.94 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  51.84 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  50.15 
 
 		 353 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  46.75 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  50.92 
 
 		 345 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  50.15 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  54.93 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  50.91 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  53.09 
 
 		 363 aa  319  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  50.61 
 
 		 345 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  50.31 
 
 		 345 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  48 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  47.04 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  52.94 
 
 		 352 aa  316  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  50 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  51.21 
 
 		 367 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  52.94 
 
 		 352 aa  315  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  48.94 
 
 		 338 aa  308  8e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  52.24 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  45.54 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  49.06 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  51.94 
 
 		 371 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  49.69 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  49.69 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  48.99 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  49.28 
 
 		 371 aa  301  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  52.13 
 
 		 356 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  51.35 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  51.94 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  53.35 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  53.09 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  48.43 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  52.78 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  50.15 
 
 		 371 aa  299  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  48.11 
 
 		 327 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  50.91 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  48.79 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  47.98 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  48.45 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  47.01 
 
 		 364 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  45.67 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.01 
 
 		 370 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  47.92 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  48.61 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  49.08 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  48.74 
 
 		 337 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  47.42 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  49.09 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  46.85 
 
 		 335 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  47.85 
 
 		 347 aa  291  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  46.18 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  48.35 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  47.48 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  47.48 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  47.48 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  47.48 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  46.15 
 
 		 377 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  46.15 
 
 		 377 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  47.24 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  45.09 
 
 		 345 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  47.85 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  47.55 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  47.55 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  47.21 
 
 		 340 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  47.32 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  48.15 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  46.45 
 
 		 377 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  44.8 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  48.15 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  47.4 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  47.09 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  50.44 
 
 		 355 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  47.09 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  47.24 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>