57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2016 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.84 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.21 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.22 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.6 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.68 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.65 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.65 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  38.6 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.55 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.44 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.48 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  39.55 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.83 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.17 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  38.22 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.89 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  36.86 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.09 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.81 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.28 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  38.6 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.65 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.57 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.19 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.33 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.02 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  36 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  35.02 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.02 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.13 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.13 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.49 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  30.84 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.17 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.75 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  28.04 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  28.9 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.36 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  29.15 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  29.52 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.02 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.02 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  26.89 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.39 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.57 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.14 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.51 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.57 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.54 
 
 		 322 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.55 
 
 		 317 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.71 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.5 
 
 		 321 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  26 
 
 		 321 aa  51.6  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  27.44 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.01 
 
 		 314 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>