238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1406 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  77.72 
 
 		 194 aa  296  9e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  67.86 
 
 		 196 aa  246  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  55.38 
 
 		 194 aa  204  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  55.84 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  55.15 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  53.65 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  52.31 
 
 		 194 aa  194  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  48.44 
 
 		 200 aa  188  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  50.51 
 
 		 195 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  50.26 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  50.51 
 
 		 196 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  50.77 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 		 189 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  47.15 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  47.15 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  48.65 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  47.94 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  45.55 
 
 		 191 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  45.6 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  44.33 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  45.13 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  42.78 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  45.95 
 
 		 191 aa  151  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 		 190 aa  150  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 		 193 aa  148  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 		 188 aa  145  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  42.02 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  42.49 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  44.33 
 
 		 189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 		 202 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  36.98 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  43.72 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  32.72 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>