More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1935 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  87.89 
 
 		 422 aa  761    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 422 aa  860    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  71.36 
 
 		 419 aa  619  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  63.39 
 
 		 428 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  61.41 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  58.37 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  58.13 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  57.66 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  58.13 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  57.89 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  58.13 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  57.66 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  57.66 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  57.42 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  56.76 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  57.66 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  56.76 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  57.66 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  57.49 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  56.87 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  47.67 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  45.04 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  43.87 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.21 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  45.1 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  43.5 
 
 		 450 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  45.37 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.23 
 
 		 731 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  43.91 
 
 		 432 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  43.44 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  45.15 
 
 		 456 aa  345  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  43.61 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  43.88 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  43.94 
 
 		 440 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  44.9 
 
 		 463 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.77 
 
 		 739 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  44.36 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.3 
 
 		 726 aa  338  9e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  43.95 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  42.08 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  43.98 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  43.26 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  42.37 
 
 		 432 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  42.92 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  42.92 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  41.27 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  42.92 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  42.28 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  42.12 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  42.51 
 
 		 735 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  43.16 
 
 		 448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  41.79 
 
 		 415 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  43.6 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  42.89 
 
 		 436 aa  325  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  41.65 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  39.28 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  39.77 
 
 		 519 aa  322  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  44.42 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  44.5 
 
 		 456 aa  322  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  42.69 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  40.75 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  42.36 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  41.03 
 
 		 485 aa  318  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  42.26 
 
 		 721 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  41.06 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  39.8 
 
 		 408 aa  317  3e-85  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  40.49 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 463 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  40.65 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  40.2 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  40.77 
 
 		 490 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  38.82 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  40.76 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.19 
 
 		 733 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  42.19 
 
 		 484 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  38.79 
 
 		 416 aa  312  5.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  42.45 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  41.98 
 
 		 456 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  41.28 
 
 		 505 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  42.65 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  42.45 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  39.86 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  41.37 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  42.65 
 
 		 465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  41.78 
 
 		 473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  40.43 
 
 		 452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.8 
 
 		 734 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.8 
 
 		 734 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  42.89 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  42.22 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  42.28 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  40.61 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>