53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2450 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  49.41 
 
 		 682 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  87.18 
 
 		 702 aa  1293    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  53.1 
 
 		 683 aa  710    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  86.48 
 
 		 710 aa  1294    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  100 
 
 		 699 aa  1454    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  86.2 
 
 		 710 aa  1291    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  48.01 
 
 		 672 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  69.15 
 
 		 707 aa  1035    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  86.06 
 
 		 710 aa  1288    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  63.81 
 
 		 676 aa  868    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  89.66 
 
 		 703 aa  1281    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  71.08 
 
 		 697 aa  1037    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  65.28 
 
 		 684 aa  943    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  50.29 
 
 		 677 aa  682    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  71.05 
 
 		 727 aa  1040    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  57.77 
 
 		 703 aa  793    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  88.29 
 
 		 703 aa  1285    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  50.3 
 
 		 680 aa  650    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  87.86 
 
 		 703 aa  1280    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  50.08 
 
 		 673 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  44.07 
 
 		 693 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  45 
 
 		 701 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  45.59 
 
 		 606 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  40.9 
 
 		 700 aa  531  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  39.67 
 
 		 726 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  39.86 
 
 		 711 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  38.98 
 
 		 727 aa  495  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  39.41 
 
 		 707 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  38.68 
 
 		 728 aa  465  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  37.01 
 
 		 704 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  34.84 
 
 		 1255 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.4 
 
 		 682 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 678 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  28.41 
 
 		 655 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  27.43 
 
 		 659 aa  240  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  29.51 
 
 		 647 aa  239  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.35 
 
 		 656 aa  234  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  29.16 
 
 		 679 aa  234  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  27.94 
 
 		 656 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  29.02 
 
 		 648 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.58 
 
 		 615 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  28.66 
 
 		 658 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  24.89 
 
 		 630 aa  157  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  26.33 
 
 		 571 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.73 
 
 		 643 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.19 
 
 		 649 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  24.43 
 
 		 629 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  23.68 
 
 		 574 aa  134  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  25.05 
 
 		 674 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  23.58 
 
 		 661 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.27 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  23.28 
 
 		 647 aa  95.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.39 
 
 		 648 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>