More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1818 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  94.55 
 
 		 257 aa  487  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  94.16 
 
 		 257 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  93.77 
 
 		 257 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  88.33 
 
 		 257 aa  454  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  85.94 
 
 		 257 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  85.94 
 
 		 257 aa  440  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  85.55 
 
 		 257 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  85.55 
 
 		 257 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  66.8 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  68.87 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  66.41 
 
 		 257 aa  339  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  65.23 
 
 		 256 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  67.58 
 
 		 256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  65.23 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  60.7 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  51.94 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  54.12 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  53.94 
 
 		 259 aa  251  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  53.28 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  50.39 
 
 		 259 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  51.95 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  49.22 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  48.83 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  48.44 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  50.77 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  48.44 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  48.05 
 
 		 280 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  48.45 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  40.25 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35.98 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  38.14 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  37.45 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  36.4 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  40.17 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  37.89 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  38.28 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  38.28 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  38.28 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  38.28 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  38.28 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  37.89 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  38.4 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  39.29 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  38.4 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  38.4 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  37.89 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  37.45 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  38.08 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  37.25 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  37.89 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  35.51 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  35.1 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  38.17 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  36.48 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  39.43 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  39.24 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  37.5 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  37.5 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  37.5 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  34.8 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  37.3 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  36.33 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  34.12 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  34.12 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  34.12 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  35.5 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  38.74 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  35.5 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  36.11 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  35.16 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  36.95 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  35.06 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  37.18 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  35.83 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  37.94 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  38.06 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  35.68 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  35.43 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  35.43 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  35.04 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  35.04 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  35.59 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  37.7 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  35.04 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  35.43 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  35.68 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  35.68 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  36.47 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  34.52 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  34.52 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  34.52 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  34.52 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  35.68 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>