More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2855 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
123 aa  239  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
365 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
253 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  41.35 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  40.38 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 
357 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  43.14 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  30.91 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
233 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  30.91 
 
 
253 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
232 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
253 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 
236 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  37.89 
 
 
236 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
253 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  41.82 
 
 
285 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  46.24 
 
 
441 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
247 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
305 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  40.21 
 
 
236 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
348 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 
272 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  44.05 
 
 
322 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  41.07 
 
 
355 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  37.5 
 
 
259 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 
346 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 
349 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  33.66 
 
 
227 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  42.35 
 
 
317 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
235 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
314 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  41.18 
 
 
310 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  39.6 
 
 
422 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  46.53 
 
 
360 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  44.57 
 
 
229 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.08 
 
 
234 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  46.67 
 
 
309 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  40.2 
 
 
310 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
232 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  43.96 
 
 
239 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  43.62 
 
 
1099 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
238 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  44.32 
 
 
299 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0559  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.73 
 
 
515 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
322 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  35.29 
 
 
316 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 
235 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
227 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0422  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 
515 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
284 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0561  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.73 
 
 
526 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
235 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  44.09 
 
 
261 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
257 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 
326 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
227 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
291 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.63 
 
 
322 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  43.88 
 
 
327 aa  57  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  43.02 
 
 
242 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
227 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.05 
 
 
324 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  40.22 
 
 
1015 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  33 
 
 
332 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  43.18 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
328 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
233 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
329 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  39.25 
 
 
281 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  42.7 
 
 
266 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  32.06 
 
 
234 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  43.48 
 
 
231 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
232 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
226 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 
240 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
1301 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
289 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.78 
 
 
244 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  42 
 
 
322 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
323 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  41.57 
 
 
672 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.99 
 
 
229 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  41.57 
 
 
257 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  40.7 
 
 
308 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  40.82 
 
 
479 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
232 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  35.63 
 
 
235 aa  54.3  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
277 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  30.36 
 
 
325 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
221 aa  54.7  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  43.82 
 
 
458 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  30.23 
 
 
306 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
391 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
235 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  38.71 
 
 
259 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
292 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>