More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2791 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  100 
 
 
264 aa  518  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 
264 aa  227  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
262 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
268 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
267 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
263 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 
267 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
436 aa  206  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 
267 aa  206  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 
288 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 
270 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
275 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
267 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 
270 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 
270 aa  201  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.23 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 
270 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 
270 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 
270 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
280 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 
270 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
450 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 
270 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
288 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
288 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
260 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
444 aa  198  6e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
264 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
278 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
285 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
490 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  45.57 
 
 
266 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 
264 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  42.26 
 
 
268 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  48.33 
 
 
308 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  45.52 
 
 
268 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  43.25 
 
 
264 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
261 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
261 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
272 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
274 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
261 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 
283 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
497 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
456 aa  188  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
266 aa  188  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  41.92 
 
 
268 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
264 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3672  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 
284 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  0.238942 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
265 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  45.85 
 
 
271 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  39 
 
 
273 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  39.38 
 
 
274 aa  185  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  47.78 
 
 
299 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  40.53 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.39 
 
 
270 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 
449 aa  181  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  38.89 
 
 
270 aa  181  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 
449 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 
282 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 
282 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 
282 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 
270 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
497 aa  178  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 
266 aa  178  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 
266 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 
270 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  40.96 
 
 
290 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  46.03 
 
 
279 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.01 
 
 
452 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 
448 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
271 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 
266 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>