More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1649 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 434 aa  874    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  66 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 		 411 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 418 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 		 412 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  62.94 
 
 		 420 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 412 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 427 aa  511  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.99 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.25 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 412 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.03 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 412 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 414 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 413 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  63.2 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0075  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.29 
 
 		 413 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 414 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.46 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.96 
 
 		 412 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 416 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.6 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  59.2 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  65.42 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  60.89 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 437 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 416 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  58.62 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  61.13 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  60.84 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 432 aa  487  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.66 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 440 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 474 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  59.29 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 438 aa  481  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1661  Glycine hydroxymethyltransferase  60.79 
 
 		 421 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0915  Glycine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 423 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 423 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  56.44 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  57.43 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 435 aa  478  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>