More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1141 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 310 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  44.44 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  40.2 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  40.85 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  40.53 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  39.4 
 
 		 313 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  38.41 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  40.94 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  40.14 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  37.37 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  36.04 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  34.77 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  38.13 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  34.98 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  40.43 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  32.69 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  36.24 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.03 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.03 
 
 		 311 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  34.63 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  32.36 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  39.34 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.35 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.35 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  38.18 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  31.75 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.37 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  32.24 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  36.55 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  36.91 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  34.86 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  35.08 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  36.92 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  40.65 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  35.99 
 
 		 347 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  37.02 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  36.22 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  32.05 
 
 		 344 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  36.69 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  31.64 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  40.45 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 		 368 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 		 292 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  38.69 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  32.89 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.43 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.84 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  29.94 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  33.98 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  35.46 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  34.85 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  32.33 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  36.17 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  33.65 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  36.24 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  32.67 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  32.11 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  32.11 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  47.8 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  35.65 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  36.45 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  33.57 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  36.18 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  38.46 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.23 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  36.24 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  33.21 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  33.21 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  33.21 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  33.21 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  33.21 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 344 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  47.8 
 
 		 497 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  30.86 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  30.87 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  30.9 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  33.13 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  30.38 
 
 		 322 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  34.74 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  34.46 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  36.24 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  34.7 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  26.5 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>