More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2690 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2690  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 127 aa  263  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450776  normal  0.2513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1029  histidine triad (HIT) protein  98.43 
 
 		 131 aa  259  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0199  histidine triad (HIT) protein  92.91 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  75.81 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  70 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  65.32 
 
 		 123 aa  164  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  64.71 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  56.67 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  55 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  52.89 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  50.42 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  44.83 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  46.09 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  44.35 
 
 		 116 aa  97.4  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.06 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.61 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 121 aa  90.5  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  45 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  42.37 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  41.88 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  40.54 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  42.02 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  39.66 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  40.68 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  43.36 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  41.18 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  44.14 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  41.18 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  36.97 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  41.18 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  41.18 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  40.71 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  42.48 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  41.18 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  38.52 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  38.66 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  38.66 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  38.66 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  38.66 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  40.68 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  42.74 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  39.5 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  39.5 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  42.5 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  39.5 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  36.29 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  36.97 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  42.5 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  42.5 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  35.77 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  38.98 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  37.07 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  36.44 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  36.44 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  36.44 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  36.8 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  36.75 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  37.61 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  40.83 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0977  HIT family protein  37.5 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  36.13 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  35.59 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  38.79 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  37.5 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>