74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0459 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  762    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  91.05 
 
 		 391 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  59.49 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  54.26 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  55.07 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  49.29 
 
 		 370 aa  272  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  36.52 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  35.43 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  35.17 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  35.57 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  32.36 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  35.17 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  33.14 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  34.19 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  32.44 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.25 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  32.82 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.71 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  30.26 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  42.55 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  30.37 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  29.56 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.79 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  23.47 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  23.47 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  21.73 
 
 		 676 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  27.52 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.17 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  28.48 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  23.29 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  27.78 
 
 		 672 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  26.35 
 
 		 672 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  26.03 
 
 		 635 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  23.91 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.15 
 
 		 515 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.29 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>