88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3851 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  98.15 
 
 		 594 aa  216  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  215  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  85.05 
 
 		 548 aa  186  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  85.05 
 
 		 548 aa  186  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  85.05 
 
 		 548 aa  186  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  64.15 
 
 		 562 aa  142  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  65.09 
 
 		 562 aa  141  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  64.15 
 
 		 562 aa  140  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  63.21 
 
 		 562 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  59.26 
 
 		 566 aa  123  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3064  hypothetical protein  67.35 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  36.84 
 
 		 275 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  35.8 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  30.97 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 		 563 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 		 487 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  36 
 
 		 586 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  36 
 
 		 586 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  36 
 
 		 586 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  36 
 
 		 586 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  36 
 
 		 586 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  42.37 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 		 586 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 		 511 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 		 511 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 		 540 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 		 555 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  36.54 
 
 		 508 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0559  transposase  40.66 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  36.54 
 
 		 508 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  34.23 
 
 		 642 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  50 
 
 		 532 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  47.62 
 
 		 540 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  50 
 
 		 532 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  50 
 
 		 526 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  37.07 
 
 		 578 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  37.07 
 
 		 578 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  37.07 
 
 		 578 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  43.48 
 
 		 570 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  39.62 
 
 		 580 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  43.48 
 
 		 570 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  30.84 
 
 		 566 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  41.51 
 
 		 573 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  41.51 
 
 		 573 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  32.71 
 
 		 561 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  32.43 
 
 		 559 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  39.29 
 
 		 629 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  34 
 
 		 596 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  34 
 
 		 596 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  34 
 
 		 596 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  26.17 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  43.59 
 
 		 538 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  43.59 
 
 		 538 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  43.59 
 
 		 538 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  43.59 
 
 		 538 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  43.14 
 
 		 504 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  43.14 
 
 		 504 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  43.14 
 
 		 504 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  29.63 
 
 		 414 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  28.18 
 
 		 604 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  43.75 
 
 		 275 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  29.73 
 
 		 604 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  29.09 
 
 		 603 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  28.38 
 
 		 513 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  29.73 
 
 		 604 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  29.73 
 
 		 604 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3882  Transposase-like protein  29.73 
 
 		 460 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.693522  normal  0.254158 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  30.67 
 
 		 548 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  30.67 
 
 		 547 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  29.73 
 
 		 604 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1821  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 		 522 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  38.1 
 
 		 534 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  38.1 
 
 		 534 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  52.94 
 
 		 579 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  37.5 
 
 		 545 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  38.1 
 
 		 534 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>