137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1039 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1039  transposase  100 
 
 
534 aa  1104    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  99.44 
 
 
534 aa  1097    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  99.63 
 
 
534 aa  1100    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  50.19 
 
 
536 aa  545  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  49.81 
 
 
536 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  49.81 
 
 
536 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  50.75 
 
 
531 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  50.75 
 
 
531 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  47.56 
 
 
539 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  47.65 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  47.65 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  48.49 
 
 
545 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  48.47 
 
 
507 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  49.67 
 
 
462 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  43.62 
 
 
534 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  48.56 
 
 
417 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  43.42 
 
 
374 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  36.87 
 
 
544 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  36.87 
 
 
544 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  36.26 
 
 
537 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  35.49 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  52.65 
 
 
400 aa  253  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  51.02 
 
 
272 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  30.88 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  29.98 
 
 
552 aa  197  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  29.98 
 
 
552 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  29.98 
 
 
552 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  29.98 
 
 
552 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  29.98 
 
 
552 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  30.46 
 
 
552 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  28.41 
 
 
560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  28.41 
 
 
560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  29.2 
 
 
552 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  29.2 
 
 
552 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  29.2 
 
 
552 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  29.2 
 
 
552 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  28.25 
 
 
560 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  28.25 
 
 
560 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  28.25 
 
 
560 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  28.99 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  28.25 
 
 
560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  28.99 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  28.78 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  29.2 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  28.99 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  28.78 
 
 
552 aa  173  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  28.78 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  30.88 
 
 
402 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  25.97 
 
 
572 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  25.97 
 
 
572 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  24.95 
 
 
538 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  24.95 
 
 
538 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  24.95 
 
 
538 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  24.95 
 
 
538 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  24.95 
 
 
538 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  24.95 
 
 
538 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  24.63 
 
 
537 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  24.63 
 
 
537 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1590  transposase  83.67 
 
 
53 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0577947  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2828  hypothetical protein  43.96 
 
 
101 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0550197  normal  0.193636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  43.21 
 
 
93 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2373  transposase  49.18 
 
 
71 aa  71.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  24.14 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  20.49 
 
 
562 aa  68.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  23.48 
 
 
594 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  25.55 
 
 
566 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  22.03 
 
 
548 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  22.03 
 
 
548 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  22.03 
 
 
548 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.88 
 
 
587 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.88 
 
 
587 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  21.92 
 
 
562 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  23.91 
 
 
574 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  22.02 
 
 
562 aa  61.6  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  21.79 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  23.45 
 
 
596 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  23.48 
 
 
574 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  28.32 
 
 
604 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3882  Transposase-like protein  35.06 
 
 
460 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.693522  normal  0.254158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  35.06 
 
 
604 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  35.06 
 
 
604 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  35.06 
 
 
603 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  25.88 
 
 
604 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  35.06 
 
 
604 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  35.06 
 
 
604 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>