More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3803 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  94.05 
 
 
370 aa  698    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
374 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  94.12 
 
 
374 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  73.42 
 
 
370 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  73.15 
 
 
368 aa  528  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  73.76 
 
 
368 aa  504  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 
368 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  59.62 
 
 
385 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  57.26 
 
 
392 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  59 
 
 
389 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  59.56 
 
 
393 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  57.61 
 
 
371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  59 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  57.14 
 
 
378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  58.7 
 
 
383 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  55.38 
 
 
376 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  56.52 
 
 
373 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  56.52 
 
 
373 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  54.35 
 
 
379 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  54.03 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  55.43 
 
 
376 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  55.46 
 
 
379 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  56.15 
 
 
377 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  53.76 
 
 
382 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 
378 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 
378 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  54.79 
 
 
387 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  54.11 
 
 
377 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  54.11 
 
 
377 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  55.26 
 
 
376 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
396 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  54.05 
 
 
386 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 
378 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
375 aa  371  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  55.98 
 
 
376 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  55.89 
 
 
390 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  51.64 
 
 
373 aa  329  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  50.83 
 
 
380 aa  315  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 
377 aa  309  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 
377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  47.4 
 
 
371 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 
372 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
373 aa  291  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.59 
 
 
390 aa  289  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  45.5 
 
 
376 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  47.43 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  46.26 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  44.56 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
372 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  48.23 
 
 
374 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.75 
 
 
373 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 
372 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  48.23 
 
 
374 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  49.47 
 
 
368 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 
368 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  44.05 
 
 
376 aa  275  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
378 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  275  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 
374 aa  275  9e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  44.82 
 
 
373 aa  275  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.93 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.57 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  44.92 
 
 
379 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  40.58 
 
 
406 aa  272  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
373 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  48.23 
 
 
374 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.99 
 
 
376 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
372 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.4 
 
 
373 aa  269  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 
372 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
375 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  48.33 
 
 
377 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  41.82 
 
 
376 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 
370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>