278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2051 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3091  allantoate amidohydrolase  86.76 
 
 		 426 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.60133  normal  0.601215 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3446  allantoate amidohydrolase  86.52 
 
 		 426 aa  712    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2051  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 425 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.423886  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3434  allantoate amidohydrolase  76.72 
 
 		 423 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5813  allantoate amidohydrolase  47.62 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734094  normal  0.203308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2278  allantoate amidohydrolase  46.97 
 
 		 421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3010  allantoate amidohydrolase  42.61 
 
 		 429 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5802  allantoate amidohydrolase  43.91 
 
 		 428 aa  260  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587062  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5680  allantoate amidohydrolase  39.23 
 
 		 438 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00010355  normal  0.0526524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5903  allantoate amidohydrolase  38.76 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00734582  hitchhiker  0.00704513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1768  allantoate amidohydrolase  36.7 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.67714  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.1 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.59 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  32.26 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.61 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.82 
 
 		 415 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  34.42 
 
 		 417 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  30.85 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  31.95 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  31.08 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  33.65 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  32.39 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  32.39 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.33 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.39 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  32.31 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  32.39 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  31.58 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  36.61 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  36.61 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  36.61 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  36.61 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  36.61 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  36.61 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.27 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  36.71 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  36.18 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  29.7 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 425 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 425 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 423 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.39 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  34.15 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  32.87 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  32.47 
 
 		 409 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  33.42 
 
 		 419 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  30.91 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  36.81 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  31.19 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  28.94 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.79 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  31.19 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  31.19 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.73 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.79 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  31.19 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  34.24 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  32.33 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.79 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  33.07 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  31.3 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  29.8 
 
 		 424 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  31.72 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  31.76 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  29.25 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  30.4 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.1 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.85 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  31.76 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  32.08 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  31.89 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  34.97 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  34.02 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.08 
 
 		 523 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  29.82 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  29.12 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  30.83 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  31.32 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  29.7 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  30.86 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  31.48 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  29.2 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  37.2 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.06 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.91 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  29.33 
 
 		 425 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  34.69 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  31.4 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  31.06 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  29.4 
 
 		 430 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>