More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1185 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1185  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126393  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1306  peptidase M48, Ste24p  92.98 
 
 		 228 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.278651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2649  putative Zn-dependent protease  92.11 
 
 		 228 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157554  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2687  peptidase M48, Ste24p  61.78 
 
 		 232 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  60.79 
 
 		 228 aa  288  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  68.57 
 
 		 230 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3987  peptidase M48, Ste24p  64.89 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.14 
 
 		 494 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.94 
 
 		 264 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  25.99 
 
 		 632 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  32.05 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  25.55 
 
 		 632 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 472 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  31.31 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 		 640 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 		 494 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.28 
 
 		 285 aa  72  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  27.75 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  27.75 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  35.42 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.98 
 
 		 561 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  28.21 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  28.21 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  28.21 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  28.21 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  28.21 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  28.21 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.19 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  30.82 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  26.5 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 		 588 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 569 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 604 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  30.49 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 		 564 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  30.86 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 		 564 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 		 564 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 504 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 		 588 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  29.65 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 		 588 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  28.04 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  26.5 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  26.27 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  28.74 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  30.06 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.7 
 
 		 589 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  24.55 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  31.79 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 489 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  32.56 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  29.03 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  29.29 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  29.02 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  24.55 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  24.55 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5407  peptidase M48 Ste24p  26.7 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  29.03 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  28.83 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.71 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  32.9 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  28.78 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  29.34 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  31.65 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  32.54 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  36 
 
 		 593 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  24 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.45 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  28.57 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  32.39 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 562 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  27.13 
 
 		 489 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  31.98 
 
 		 590 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  29.65 
 
 		 481 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>