174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1035 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  81.32 
 
 		 546 aa  915    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  81.32 
 
 		 546 aa  915    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1103    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.67 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  52.16 
 
 		 536 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.59 
 
 		 531 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.56 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.77 
 
 		 560 aa  276  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  34.7 
 
 		 563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 560 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 560 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  32.33 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  34.95 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.69 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.52 
 
 		 547 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.7 
 
 		 560 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.2 
 
 		 549 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  33.47 
 
 		 563 aa  253  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.83 
 
 		 563 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.86 
 
 		 556 aa  250  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  34 
 
 		 598 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.46 
 
 		 599 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.13 
 
 		 566 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.7 
 
 		 629 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  30.68 
 
 		 558 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  32.86 
 
 		 661 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.27 
 
 		 672 aa  232  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  35.27 
 
 		 554 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.42 
 
 		 549 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.94 
 
 		 549 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  33.95 
 
 		 557 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 668 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  31.49 
 
 		 811 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.84 
 
 		 716 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.88 
 
 		 625 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.64 
 
 		 636 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 775 aa  220  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.51 
 
 		 637 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  31.99 
 
 		 656 aa  217  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.16 
 
 		 525 aa  216  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  28.34 
 
 		 568 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  30.78 
 
 		 718 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  31.25 
 
 		 572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  33.65 
 
 		 540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.79 
 
 		 670 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 654 aa  210  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 646 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.24 
 
 		 724 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  35.76 
 
 		 410 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.02 
 
 		 624 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  29.39 
 
 		 614 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  29.9 
 
 		 702 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  29.85 
 
 		 631 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  29.84 
 
 		 561 aa  203  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.39 
 
 		 543 aa  202  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.84 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 		 730 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.61 
 
 		 433 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.94 
 
 		 648 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.81 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 516 aa  199  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  34.63 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.11 
 
 		 662 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  34.63 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 539 aa  197  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.43 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  36.27 
 
 		 410 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  30.2 
 
 		 513 aa  193  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.77 
 
 		 526 aa  193  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  31.32 
 
 		 530 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  31.16 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  29.48 
 
 		 530 aa  190  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.9 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  34.64 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  33.98 
 
 		 524 aa  187  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.38 
 
 		 586 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.38 
 
 		 590 aa  187  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  30.61 
 
 		 564 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.73 
 
 		 434 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.07 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  30.25 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.24 
 
 		 432 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.51 
 
 		 674 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.78 
 
 		 433 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  30.85 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.24 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.66 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.78 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.43 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.43 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>