166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4016 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4129  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4016  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03039  signal peptide protein  86.69 
 
 		 263 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2108  hypothetical protein  70.31 
 
 		 263 aa  357  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0754  hypothetical protein  69.92 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0886738  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0594  hypothetical protein  69.92 
 
 		 278 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0704  hypothetical protein  69.92 
 
 		 278 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1659  hypothetical protein  69.92 
 
 		 278 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0521  hypothetical protein  69.53 
 
 		 278 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2013  hypothetical protein  69.53 
 
 		 278 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0741124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0880  hypothetical protein  74.26 
 
 		 276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2417  hypothetical protein  37.6 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1520  protein of unknown function DUF323  39.22 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  29.39 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  27.91 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.62 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  27.59 
 
 		 633 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0887  protein of unknown function DUF323  27.43 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0576  hypothetical protein  31.9 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  27.64 
 
 		 892 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.6 
 
 		 437 aa  55.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.15 
 
 		 820 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  39 
 
 		 819 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  30.12 
 
 		 1049 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  24.62 
 
 		 929 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  34.95 
 
 		 960 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  23.59 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 1007 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  27.1 
 
 		 614 aa  53.1  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  22.03 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  29.24 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 		 861 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  24.74 
 
 		 1104 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 		 621 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 		 416 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  24 
 
 		 398 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  26.63 
 
 		 416 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1012  hypothetical protein  25.97 
 
 		 480 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  24.63 
 
 		 826 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 319 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  26.32 
 
 		 416 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  27.23 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  26.24 
 
 		 751 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 		 1053 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0172  hypothetical protein  21.13 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  29.1 
 
 		 587 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 434 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  32.49 
 
 		 436 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  25.78 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1200 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  26.11 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  32.49 
 
 		 436 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  32.49 
 
 		 436 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  24.91 
 
 		 325 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 		 740 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 829 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  25.1 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  25.23 
 
 		 965 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  32.73 
 
 		 1186 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  25.31 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  34.87 
 
 		 775 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  36.27 
 
 		 923 aa  49.3  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  26.87 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  25.93 
 
 		 351 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 		 623 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  33.02 
 
 		 952 aa  48.9  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  27 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  25.98 
 
 		 433 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  32.32 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  25.57 
 
 		 636 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  27 
 
 		 664 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  28.06 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1492 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  32.32 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  32.32 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  34.62 
 
 		 425 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  26.34 
 
 		 522 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  27.21 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  27.42 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  25.87 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  27.75 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  26.67 
 
 		 620 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  33.61 
 
 		 386 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  27.14 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  23.87 
 
 		 586 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.08 
 
 		 1044 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  29.96 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  31.06 
 
 		 423 aa  46.2  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  25.28 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  33.62 
 
 		 1201 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  24.9 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  38.95 
 
 		 433 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  27.11 
 
 		 427 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  28.51 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1581 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  28.22 
 
 		 390 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0884  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 		 636 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>