More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3235 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3235  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 267 aa  527  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  98.88 
 
 		 267 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3362  hypothetical protein  76.09 
 
 		 276 aa  343  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  65.24 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  65.24 
 
 		 294 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  65.24 
 
 		 294 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  65.24 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  65.24 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  65.24 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2952  Sel1 domain-containing protein  67.4 
 
 		 285 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2814  Sel1 domain-containing protein  66.96 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499703  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  64.81 
 
 		 295 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  61.98 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2912  Sel1 domain-containing protein  65.94 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2288  Sel1 repeat-containing protein  65.5 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2903  Sel1 domain-containing protein  65.5 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6245  Sel1 repeat-containing protein  65.94 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0401  Sel1 domain-containing protein  63.45 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27663  hitchhiker  0.00849868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0573  Sel1  49.56 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.07 
 
 		 684 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.71 
 
 		 1402 aa  91.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.98 
 
 		 831 aa  89.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.77 
 
 		 961 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  38.8 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.73 
 
 		 789 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.16 
 
 		 865 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.17 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.72 
 
 		 2413 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.52 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.58 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.16 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.57 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.52 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.52 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1002 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.99 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  32.07 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  37 
 
 		 839 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.32 
 
 		 425 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.39 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.46 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.62 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  35.91 
 
 		 1430 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 685 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  35.63 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  34.01 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.11 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  34.25 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.68 
 
 		 552 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.73 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.55 
 
 		 850 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  35.22 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.04 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.55 
 
 		 680 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  41.88 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.69 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1493 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.91 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  35.22 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  35.22 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.3 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  35.22 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.05 
 
 		 798 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.05 
 
 		 838 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  27.95 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.85 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 976 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.97 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.69 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  34.83 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.18 
 
 		 523 aa  72  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.18 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.34 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.71 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  34.25 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 1032 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3443  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.87 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.97 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 		 811 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1037 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  27.33 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  27.33 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  47.19 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.34 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  38.01 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  35.15 
 
 		 679 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1796 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  40.87 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.68 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1281 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.46 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>