50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4292 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  71.92 
 
 		 2876 aa  2248    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  38.88 
 
 		 2112 aa  651    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  100 
 
 		 2890 aa  5539    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  29.21 
 
 		 5203 aa  221  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  29.72 
 
 		 5166 aa  213  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  27.72 
 
 		 5517 aa  210  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  31.75 
 
 		 2990 aa  175  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  31.69 
 
 		 1263 aa  166  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  29.24 
 
 		 5544 aa  165  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  28.73 
 
 		 2604 aa  159  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  29.33 
 
 		 1337 aa  154  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  29.33 
 
 		 1337 aa  154  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  44.58 
 
 		 759 aa  141  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  43.48 
 
 		 767 aa  138  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  33.79 
 
 		 733 aa  135  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1727 aa  114  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.15 
 
 		 2656 aa  103  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  33.72 
 
 		 3324 aa  101  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  31.34 
 
 		 666 aa  93.6  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.94 
 
 		 3373 aa  92.8  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  29.9 
 
 		 1153 aa  87.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  29.9 
 
 		 1153 aa  87.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  25.61 
 
 		 733 aa  85.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  37.75 
 
 		 1315 aa  84.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  26.68 
 
 		 1531 aa  82  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  31.03 
 
 		 965 aa  74.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  31.03 
 
 		 965 aa  74.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 2047 aa  70.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1665 aa  68.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  28.44 
 
 		 1243 aa  68.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  29.1 
 
 		 892 aa  68.6  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  30.92 
 
 		 3394 aa  63.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  27.09 
 
 		 8918 aa  63.2  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  28.88 
 
 		 870 aa  63.2  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  29.24 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 1519 aa  58.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.95 
 
 		 1336 aa  58.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  30.13 
 
 		 436 aa  57  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  31.34 
 
 		 813 aa  55.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  34.17 
 
 		 130 aa  52.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1809 aa  51.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  35.54 
 
 		 892 aa  50.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  32 
 
 		 333 aa  49.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  34.17 
 
 		 1150 aa  48.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.12 
 
 		 371 aa  48.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0186  hypothetical protein  36.36 
 
 		 282 aa  47.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  39.62 
 
 		 621 aa  47  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1537 aa  46.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0131  hypothetical protein  34.74 
 
 		 266 aa  46.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  42.67 
 
 		 917 aa  46.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>