12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0131 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0129  hypothetical protein  56.3 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0130  hypothetical protein  55.08 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6957  hypothetical protein  37.01 
 
 		 372 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 371 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6956  hypothetical protein  28.5 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  37.23 
 
 		 659 aa  52.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  38.36 
 
 		 2656 aa  49.7  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  34.74 
 
 		 2890 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  29.1 
 
 		 1519 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  44.23 
 
 		 870 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  50 
 
 		 2047 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>