16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0129 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0130  hypothetical protein  76.03 
 
 		 265 aa  345  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0131  hypothetical protein  56.3 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.63 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6957  hypothetical protein  32.12 
 
 		 372 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6956  hypothetical protein  27.19 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  41.54 
 
 		 2656 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  31.03 
 
 		 1243 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  41.43 
 
 		 2890 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.95 
 
 		 3373 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  38.96 
 
 		 8918 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  40.74 
 
 		 2112 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  29.07 
 
 		 2047 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  38.71 
 
 		 5544 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  37.35 
 
 		 2876 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  25.64 
 
 		 1531 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>