256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3598 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3598  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  336  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  86.05 
 
 		 173 aa  271  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1869  GatB/YqeY domain-containing protein  51.11 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.329708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  43.79 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  44.71 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  41.42 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  44.19 
 
 		 513 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  40.24 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  38.82 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  36.69 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  38.24 
 
 		 147 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  38.24 
 
 		 147 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  38.24 
 
 		 147 aa  111  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  38.24 
 
 		 147 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  38.24 
 
 		 147 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  38.24 
 
 		 147 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  39.29 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  39.77 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  38.24 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  38.24 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  38.24 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  34.71 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  38.37 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  37.65 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  38.82 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  38.82 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  38.24 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  39.41 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.94 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  38.24 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  37.65 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  37.65 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  39.41 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  38.24 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  35.29 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  37.65 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  39.49 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  35.88 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  33.14 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  38.85 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  36.47 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  36.31 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  31.76 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  35.67 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  40.83 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  37.06 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  34.3 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  34.91 
 
 		 147 aa  98.6  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  97.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  35.33 
 
 		 150 aa  97.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  36.47 
 
 		 151 aa  97.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  36.47 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  37.58 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  37.06 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  35.98 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  35.5 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  36.42 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  36.94 
 
 		 148 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  34.71 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  35.76 
 
 		 148 aa  95.1  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  35.67 
 
 		 147 aa  94  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  36.94 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  39.49 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  35.67 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  34.91 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  34.91 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  38.1 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  36.63 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  38.22 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  36.47 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  33.93 
 
 		 146 aa  92  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 		 152 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  43.27 
 
 		 153 aa  91.3  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  36.59 
 
 		 151 aa  91.3  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  37.97 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  33.53 
 
 		 149 aa  91.3  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  34.5 
 
 		 147 aa  90.9  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  36.94 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  43.81 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  34.39 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  34.39 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  36.26 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  37.72 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  35.19 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  33.73 
 
 		 147 aa  89.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  37.34 
 
 		 152 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  37.65 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  37.34 
 
 		 152 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  33.73 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  34.5 
 
 		 148 aa  87.8  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  31.55 
 
 		 146 aa  87.4  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  34.94 
 
 		 147 aa  87.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  33.73 
 
 		 149 aa  87.4  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  34.12 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>