More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1698 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 349 aa  695    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  90.52 
 
 		 349 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0899  Polyprenyl synthetase  58.26 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0021773  hitchhiker  0.000000547465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  50.96 
 
 		 326 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.81 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.33 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  39.54 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.99 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.69 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.37 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.14 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  36.33 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.87 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.86 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  36.33 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.73 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  31.48 
 
 		 322 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  39.8 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0392  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  36.13 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.23 
 
 		 320 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.2 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.83 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  37.37 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.54 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  38.91 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.54 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  36.01 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.2 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.19 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.91 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.91 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.91 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  39.81 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.91 
 
 		 320 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.91 
 
 		 320 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.27 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.91 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.59 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  36.42 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 322 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  33.87 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  34.72 
 
 		 344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  34.52 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  37.22 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.12 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.12 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.99 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.59 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.94 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  37.01 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  38.51 
 
 		 322 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  43.29 
 
 		 334 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  38.73 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.83 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  34.01 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  38.19 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 322 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  34.34 
 
 		 324 aa  176  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  33.43 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  34.29 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  35.26 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.25 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.79 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  31.79 
 
 		 318 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  37.03 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  36.31 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  39.49 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.84 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  34.73 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.56 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  31.73 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.28 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  31.73 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.28 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  32.8 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  34.08 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  34.41 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  34.21 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  33.63 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  32.66 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  32.37 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  36.31 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.6 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0139  polyprenyl synthetase  37.24 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.82 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  31.19 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.2 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.77 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.15 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.85 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>