More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5501 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.67 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 		 287 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.9 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.36 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.98 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.77 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.38 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.47 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.54 
 
 		 659 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.13 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744072  decreased coverage  0.0000000565271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.92 
 
 		 662 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.2 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.5 
 
 		 662 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.64 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>