77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5240 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  53.94 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  51.03 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3018  hypothetical protein  37.84 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  33.83 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1615  hypothetical protein  29.95 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0192  hypothetical protein  27.31 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  27.75 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  27.57 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  30.95 
 
 		 897 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  27.27 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  32.71 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 332 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0957  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  30.7 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 310 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  28.3 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 358 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 341 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.23 
 
 		 343 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  26.8 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.69 
 
 		 391 aa  46.2  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  28.41 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  29.14 
 
 		 395 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 470 aa  45.4  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  30.58 
 
 		 382 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  27.5 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 1177 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 681 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  26.39 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 1312 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  32.35 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  42.22 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  31.71 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.66 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  31.91 
 
 		 401 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.97 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.56 
 
 		 672 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  31.96 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2204  methyltransferase type 12  25.37 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2106  methyltransferase type 12  29.3 
 
 		 565 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 1177 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  19.92 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  31.91 
 
 		 401 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.91 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  27.98 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 310 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  22.98 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.91 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28 
 
 		 359 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 1314 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 326 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  27.72 
 
 		 228 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 333 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>