21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0192 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0192  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1615  hypothetical protein  53.72 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  29.29 
 
 
243 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  27.07 
 
 
242 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  28.22 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  28.37 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3018  hypothetical protein  27.36 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  25.4 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  25.88 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
543 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
394 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
335 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  20.22 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  23.86 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  31.91 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0957  methyltransferase type 11  20.73 
 
 
184 aa  42  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  23.66 
 
 
266 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.39 
 
 
246 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>