29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2356 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  100 
 
 
470 aa  936    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0272  Methyltransferase type 12  58.9 
 
 
472 aa  521  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  57.6 
 
 
481 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  51.58 
 
 
537 aa  501  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1423  Methyltransferase type 12  53.41 
 
 
528 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  26.05 
 
 
496 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  29.9 
 
 
509 aa  156  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  30.42 
 
 
446 aa  156  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  28.84 
 
 
467 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  27.29 
 
 
459 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25.25 
 
 
447 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  31.47 
 
 
394 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  29.35 
 
 
283 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
285 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
285 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  33 
 
 
245 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  26.4 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
257 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
257 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  29.13 
 
 
260 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  33.04 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  33.62 
 
 
210 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
285 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  24.87 
 
 
261 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
257 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  32.79 
 
 
249 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
261 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 
418 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>