15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1615 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1615  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0192  hypothetical protein  53.72 
 
 
241 aa  251  7e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  29.86 
 
 
243 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  29.95 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3018  hypothetical protein  30.35 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  25.11 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  27.11 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  24.85 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  24.83 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1594  hypothetical protein  22.93 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  25 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  26.61 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  29.84 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  23.68 
 
 
353 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>