57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1633 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  100 
 
 
897 aa  1816    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  33.21 
 
 
637 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  33.21 
 
 
637 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  33.52 
 
 
721 aa  350  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  33.03 
 
 
687 aa  340  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  31.17 
 
 
637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  33.39 
 
 
642 aa  305  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  37.72 
 
 
548 aa  258  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  36.59 
 
 
549 aa  241  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  28 
 
 
592 aa  233  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  30.17 
 
 
635 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  33.53 
 
 
582 aa  209  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  23.67 
 
 
625 aa  197  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  29.48 
 
 
563 aa  197  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  27.39 
 
 
535 aa  184  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  31.98 
 
 
1231 aa  184  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  31.69 
 
 
1231 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  27.88 
 
 
7122 aa  180  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  27.84 
 
 
2752 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  29.25 
 
 
3811 aa  151  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  31.39 
 
 
549 aa  151  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0423  methyltransferase domain-containing protein  33.95 
 
 
297 aa  145  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  33.7 
 
 
298 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  29.57 
 
 
367 aa  134  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1303  conserved hypothetical protein, methyltransferase type 12 domain  32.47 
 
 
300 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.193595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1490  hypothetical protein  34.43 
 
 
302 aa  131  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  29.43 
 
 
613 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  30.7 
 
 
350 aa  127  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  30.36 
 
 
349 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  31.65 
 
 
347 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  30.54 
 
 
520 aa  125  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  26.2 
 
 
730 aa  125  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  30.87 
 
 
520 aa  123  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  30.19 
 
 
393 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  27.97 
 
 
356 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  29.87 
 
 
520 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  27.95 
 
 
378 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  28.8 
 
 
507 aa  111  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  25.78 
 
 
561 aa  108  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  25.16 
 
 
623 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  25.54 
 
 
430 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  23.6 
 
 
363 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  26.19 
 
 
344 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  25.42 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  23.55 
 
 
572 aa  79.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  26 
 
 
631 aa  78.2  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  24.48 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3486  hypothetical protein  36.71 
 
 
142 aa  62  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222229  normal  0.031709 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  30.95 
 
 
245 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  21.35 
 
 
309 aa  52.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
332 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  33.02 
 
 
780 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 
310 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 
246 aa  45.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  38.1 
 
 
1124 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
310 aa  45.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 
298 aa  45.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>