43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2835 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  100 
 
 		 590 aa  1201    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  34.59 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  42.69 
 
 		 631 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  30.11 
 
 		 613 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  28.78 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  29.82 
 
 		 347 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  26.36 
 
 		 535 aa  113  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  31.95 
 
 		 356 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  29.48 
 
 		 367 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  26.55 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  28.52 
 
 		 378 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  28.21 
 
 		 349 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  27.78 
 
 		 1231 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  27.78 
 
 		 1231 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  23.77 
 
 		 3811 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  25.87 
 
 		 363 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  26.18 
 
 		 340 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  28.16 
 
 		 350 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  26.28 
 
 		 2752 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  26.39 
 
 		 7122 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  27.61 
 
 		 730 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  29.41 
 
 		 623 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  24.75 
 
 		 582 aa  88.2  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  23.55 
 
 		 592 aa  84.3  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  23.57 
 
 		 561 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  27.11 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  25.76 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  25.18 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  23.97 
 
 		 637 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  24.66 
 
 		 637 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  25.93 
 
 		 549 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  26.92 
 
 		 548 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  24.82 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  23.16 
 
 		 635 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  23.1 
 
 		 687 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  24.41 
 
 		 563 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  24.57 
 
 		 897 aa  69.3  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  26.3 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  22.5 
 
 		 721 aa  67  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  22.45 
 
 		 625 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  21.89 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  25.45 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  22.03 
 
 		 642 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>