43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1964 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  100 
 
 
572 aa  1195    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  39.75 
 
 
631 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  34.59 
 
 
590 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  34.31 
 
 
613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  32.85 
 
 
350 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  32.85 
 
 
356 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  32.16 
 
 
349 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  29.35 
 
 
347 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  30.77 
 
 
393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  29.71 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  31.87 
 
 
430 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  30.43 
 
 
363 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  29.14 
 
 
378 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  28.1 
 
 
344 aa  97.4  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  28.05 
 
 
535 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  27.43 
 
 
730 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  25.42 
 
 
582 aa  90.5  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  23.99 
 
 
7122 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  26.99 
 
 
520 aa  87.8  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  26.69 
 
 
340 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  25.17 
 
 
548 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  25.85 
 
 
635 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  26.3 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  26.15 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  25.67 
 
 
1231 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  26.19 
 
 
623 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  25.41 
 
 
1231 aa  84  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  27.06 
 
 
549 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  27.91 
 
 
637 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  27.57 
 
 
637 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  23.55 
 
 
897 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  27.12 
 
 
687 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  25.5 
 
 
592 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  27.12 
 
 
721 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  24.39 
 
 
507 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  27.01 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  23.37 
 
 
2752 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  24.84 
 
 
637 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  23.59 
 
 
3811 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  26.28 
 
 
625 aa  73.9  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  24.05 
 
 
561 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  26.21 
 
 
642 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  22.22 
 
 
549 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>