45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1535 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  100 
 
 
637 aa  1268    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  98.12 
 
 
637 aa  1248    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  43.17 
 
 
637 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  42.58 
 
 
642 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  45.93 
 
 
721 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  33.21 
 
 
897 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  43.13 
 
 
687 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  32.19 
 
 
548 aa  300  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  35.2 
 
 
635 aa  294  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  34.01 
 
 
563 aa  266  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  34.26 
 
 
625 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  32.83 
 
 
592 aa  260  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  37.62 
 
 
549 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  30.3 
 
 
2752 aa  239  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  33.93 
 
 
535 aa  238  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.61 
 
 
7122 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  35.84 
 
 
1231 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  35.84 
 
 
1231 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  33.8 
 
 
582 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  29.39 
 
 
549 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  34.4 
 
 
3811 aa  183  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  33.43 
 
 
730 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  32.21 
 
 
561 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  28.84 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  29.19 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  28.84 
 
 
520 aa  134  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  30.73 
 
 
378 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  29.78 
 
 
367 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  27.49 
 
 
613 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  28.65 
 
 
350 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  28.61 
 
 
347 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  28.57 
 
 
393 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 
507 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  29.32 
 
 
349 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  30.81 
 
 
430 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  30.88 
 
 
363 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  25.48 
 
 
356 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  29.14 
 
 
340 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  28.41 
 
 
623 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3486  hypothetical protein  46.96 
 
 
142 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222229  normal  0.031709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  28.05 
 
 
572 aa  83.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  24.66 
 
 
590 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  23.76 
 
 
631 aa  69.7  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  24.17 
 
 
344 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1669  magnesium-dependent phosphatase-1  25.58 
 
 
169 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>