44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3282 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  100 
 
 
363 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  70.53 
 
 
430 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  41.48 
 
 
350 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  50.16 
 
 
393 aa  299  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  50.33 
 
 
349 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  43.35 
 
 
356 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  44.73 
 
 
367 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  41.48 
 
 
347 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  49.84 
 
 
378 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  40.72 
 
 
340 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  36.67 
 
 
613 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  32.04 
 
 
344 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  34.82 
 
 
625 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 
2752 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  29.25 
 
 
548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  27.41 
 
 
582 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  29.67 
 
 
631 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  29.78 
 
 
7122 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  27.73 
 
 
637 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  28.77 
 
 
1231 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  27.55 
 
 
3811 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  28.57 
 
 
1231 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  30.95 
 
 
635 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  30.43 
 
 
572 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  26.28 
 
 
549 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  31.18 
 
 
637 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  31.67 
 
 
687 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  31.36 
 
 
721 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  30.88 
 
 
637 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  27.55 
 
 
563 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  27.54 
 
 
592 aa  105  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  27.41 
 
 
549 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  25.87 
 
 
590 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  23.3 
 
 
897 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  26.91 
 
 
535 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  25.58 
 
 
623 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  25.89 
 
 
642 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  25.47 
 
 
730 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  25.69 
 
 
561 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  22.71 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  22.71 
 
 
520 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  22.71 
 
 
520 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  22.34 
 
 
507 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3486  hypothetical protein  34.07 
 
 
142 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222229  normal  0.031709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>