39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3486 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3486  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  279  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222229  normal  0.031709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  45.59 
 
 
635 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  44.35 
 
 
625 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  46.09 
 
 
637 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  44.71 
 
 
642 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  46.96 
 
 
637 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  47.62 
 
 
721 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  34.65 
 
 
2752 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  35.16 
 
 
7122 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  35.19 
 
 
637 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  45.57 
 
 
1231 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  45.57 
 
 
1231 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  35.96 
 
 
592 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  45 
 
 
687 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  34.78 
 
 
548 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  36.71 
 
 
897 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  30.63 
 
 
347 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  31.9 
 
 
378 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  37.27 
 
 
535 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  27.27 
 
 
393 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  29.46 
 
 
549 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  30.84 
 
 
367 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  31.76 
 
 
582 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  31.07 
 
 
563 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  29.63 
 
 
3811 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  24.07 
 
 
356 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  30 
 
 
349 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  33.73 
 
 
623 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  32.38 
 
 
430 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  22.22 
 
 
350 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  34.07 
 
 
363 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  32.69 
 
 
561 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  26.37 
 
 
613 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  32.86 
 
 
340 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 
507 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1454  FkbH domain-containing protein  34.41 
 
 
493 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.773297  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0843  FkbH domain-containing protein  34.41 
 
 
493 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0528  FkbH domain-containing protein  34.41 
 
 
493 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.524389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2159  FkbH domain-containing protein  34.41 
 
 
493 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.505215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>