44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3196 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  100 
 
 
561 aa  1160    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  33.2 
 
 
520 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  32.87 
 
 
520 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  33.13 
 
 
507 aa  282  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  32.24 
 
 
520 aa  280  6e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  30.18 
 
 
3811 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  27.86 
 
 
7122 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  28.61 
 
 
2752 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  34.2 
 
 
721 aa  157  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  26.79 
 
 
1231 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  31.5 
 
 
592 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  32.23 
 
 
1231 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  26.98 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  30.09 
 
 
582 aa  148  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  34.14 
 
 
687 aa  147  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  32.2 
 
 
637 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  31.72 
 
 
535 aa  143  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  30.03 
 
 
635 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  27.51 
 
 
563 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  32.34 
 
 
637 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  33 
 
 
637 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  31.13 
 
 
549 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  30.82 
 
 
642 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  29.24 
 
 
625 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  28.94 
 
 
549 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  25.78 
 
 
897 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  29.53 
 
 
340 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  26.92 
 
 
730 aa  91.3  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  26.4 
 
 
350 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  28.2 
 
 
349 aa  87.4  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  26.38 
 
 
623 aa  87  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  27.82 
 
 
613 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  28.85 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  28.57 
 
 
367 aa  84  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  23.57 
 
 
590 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  23.99 
 
 
631 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  27.39 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  27.95 
 
 
344 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  25.69 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  26.2 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  27.08 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  24.51 
 
 
356 aa  67  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  24.05 
 
 
572 aa  67  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3486  hypothetical protein  32.69 
 
 
142 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222229  normal  0.031709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>