45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3188 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  100 
 
 		 430 aa  841    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  70.53 
 
 		 363 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  44.1 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  50.16 
 
 		 378 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  43.41 
 
 		 350 aa  289  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  44.81 
 
 		 347 aa  282  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  39.47 
 
 		 356 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  46.06 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  42.95 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  39.29 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  34.92 
 
 		 613 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  35.38 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  34.19 
 
 		 625 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  29.41 
 
 		 631 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  27.44 
 
 		 548 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  27.79 
 
 		 549 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  31.41 
 
 		 563 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  27.88 
 
 		 582 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  31.87 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  29.04 
 
 		 635 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  27.94 
 
 		 637 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  26.55 
 
 		 590 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  28.9 
 
 		 1231 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  29.24 
 
 		 1231 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  30.81 
 
 		 637 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  33.85 
 
 		 637 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  32.21 
 
 		 721 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  31.38 
 
 		 687 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  27.13 
 
 		 2752 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  25.53 
 
 		 897 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  27.41 
 
 		 3811 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  28.28 
 
 		 592 aa  96.7  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  26.4 
 
 		 623 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  26.43 
 
 		 730 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  29.91 
 
 		 549 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.06 
 
 		 7122 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  24.78 
 
 		 535 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  26.13 
 
 		 642 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  28.05 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  22.01 
 
 		 520 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  22.01 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  21.91 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  21.77 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3486  hypothetical protein  32.38 
 
 		 142 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222229  normal  0.031709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1669  magnesium-dependent phosphatase-1  34.13 
 
 		 169 aa  44.3  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>