43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0172 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  100 
 
 		 549 aa  1126    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  37.69 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  30.43 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  35.63 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  29.68 
 
 		 637 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  28.33 
 
 		 592 aa  181  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  33.99 
 
 		 3811 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.38 
 
 		 7122 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  32.16 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  28.24 
 
 		 2752 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  32.97 
 
 		 637 aa  162  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  36.14 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  32.92 
 
 		 1231 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  32.62 
 
 		 1231 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  31.39 
 
 		 897 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  31.15 
 
 		 721 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  28.45 
 
 		 582 aa  143  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  31.44 
 
 		 625 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  29.47 
 
 		 635 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  30.9 
 
 		 687 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  32.3 
 
 		 642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  31.13 
 
 		 561 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  33.54 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  31.56 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  29.51 
 
 		 613 aa  117  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  28.38 
 
 		 730 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  30.12 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  31.51 
 
 		 623 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  31.25 
 
 		 349 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  29.87 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  29.02 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  29.94 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  27.85 
 
 		 347 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  27.41 
 
 		 363 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  30.43 
 
 		 430 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  27.12 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  26.99 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  26.99 
 
 		 520 aa  88.2  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  27.06 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  29.03 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  25.93 
 
 		 590 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  25.34 
 
 		 631 aa  73.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  27.18 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>