34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1303 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1303  conserved hypothetical protein, methyltransferase type 12 domain  100 
 
 		 300 aa  608  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.193595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1490  hypothetical protein  84.44 
 
 		 302 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0423  methyltransferase domain-containing protein  60.94 
 
 		 297 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  52.17 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  32.47 
 
 		 897 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  24.32 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  25.33 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  30.84 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  30 
 
 		 194 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  27.35 
 
 		 457 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  24.86 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  28.3 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  26.42 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  27.89 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  20.41 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  29.79 
 
 		 2112 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  26.02 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  28.91 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2280  hypothetical protein  26.36 
 
 		 189 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  22.37 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.22 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  23.03 
 
 		 383 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 196 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  23.92 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  25.86 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12801  hypothetical protein  30.48 
 
 		 275 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.838428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>