More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3800 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 287 aa  577  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  54.76 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 		 264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.61 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.37 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.67 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.53 
 
 		 261 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  39.75 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 		 270 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 268 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  34.25 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 259 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 267 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 268 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4163  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.941221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.36 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 262 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.17 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 		 265 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 		 262 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.19 
 
 		 663 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.1 
 
 		 659 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 264 aa  142  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>