55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0564 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  49.72 
 
 		 723 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  51.25 
 
 		 746 aa  739    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  48.68 
 
 		 761 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  50.5 
 
 		 788 aa  698    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  52.27 
 
 		 771 aa  701    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  49.64 
 
 		 742 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  48.38 
 
 		 819 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  47.05 
 
 		 834 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1540    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  70.79 
 
 		 791 aa  1097    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  48.17 
 
 		 723 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  50 
 
 		 742 aa  723    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  47.46 
 
 		 771 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  44.09 
 
 		 754 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  46.35 
 
 		 782 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  46.23 
 
 		 792 aa  599  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  46.8 
 
 		 914 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  46.44 
 
 		 739 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  45.05 
 
 		 785 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  45.57 
 
 		 781 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  42.2 
 
 		 752 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  51.36 
 
 		 727 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  45.19 
 
 		 769 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  43.38 
 
 		 752 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  41.34 
 
 		 786 aa  558  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  52.69 
 
 		 543 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  45.56 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  45.39 
 
 		 639 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  44.96 
 
 		 612 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  46.13 
 
 		 627 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  46.13 
 
 		 627 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  44.44 
 
 		 594 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  46.52 
 
 		 632 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  44.08 
 
 		 584 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  46.09 
 
 		 641 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  46.86 
 
 		 632 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  45.76 
 
 		 614 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  41.71 
 
 		 559 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  48.6 
 
 		 176 aa  104  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  25.42 
 
 		 375 aa  94.7  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  25.43 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.19 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  26.19 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.19 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  23.14 
 
 		 381 aa  63.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  27.6 
 
 		 309 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.77 
 
 		 375 aa  55.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.68 
 
 		 464 aa  50.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2780  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.2 
 
 		 601 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3286  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.53 
 
 		 605 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0635707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3413  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.36 
 
 		 605 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3093  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.36 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.940378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5071  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.5 
 
 		 613 aa  45.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0125848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5804  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  21.11 
 
 		 597 aa  44.3  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2999  hypothetical protein  55.56 
 
 		 87 aa  44.3  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>