More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2770 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  100 
 
 		 345 aa  677    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1567  hypothetical protein  46.25 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00460262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2092  hypothetical protein  44.79 
 
 		 256 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  45.63 
 
 		 271 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  45.66 
 
 		 270 aa  169  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  41.48 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  44.35 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.08 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.47 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.168888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  32.73 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  43.55 
 
 		 271 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  37.05 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3028  protein of unknown function DUF182  39.68 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  30.36 
 
 		 265 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  37.05 
 
 		 246 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.78 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  34.56 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10377  hypothetical protein  33.73 
 
 		 251 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000697611  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  32.44 
 
 		 541 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  32.44 
 
 		 541 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  32.44 
 
 		 541 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  32.44 
 
 		 541 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  32.2 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.82 
 
 		 541 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  32.44 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  32.2 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0481  hypothetical protein  32.16 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0492  hypothetical protein  32.16 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0503  hypothetical protein  32.16 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  33.21 
 
 		 526 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.51 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.59 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  31.98 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  37.13 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.55 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  39.53 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  40.91 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  25.09 
 
 		 277 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  30.9 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  31.47 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  29.24 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  37.21 
 
 		 357 aa  89.7  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  33.81 
 
 		 483 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  30.9 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  43.4 
 
 		 425 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  33.17 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.58 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  36.32 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  31.85 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  40.33 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  30.15 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  31.83 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  30.34 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.21 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  30.97 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  30.85 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  26.94 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.48 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  38.67 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  30.5 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  27.63 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  33.97 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  36.7 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  29.52 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  36.25 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  32.48 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  37.71 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  29.35 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  30.5 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  38.41 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.11 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  32.16 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32.5 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  34.13 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  31.18 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.81 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  32.12 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  37.5 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.75 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  32.72 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  36.65 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  30.5 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  22.43 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.4 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 		 108 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.07 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  29.7 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.85 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  36.59 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  34.78 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.13 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0727  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  27.6 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.666329  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0679  protein of unknown function DUF182  30.41 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.350419  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.62 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  30.28 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.95 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.96 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  37.06 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  33.97 
 
 		 230 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  32.69 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>