296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2242 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  100 
 
 		 317 aa  649    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2725  putative signal transduction protein  32.31 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  31.5 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  30.83 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.51 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  30.7 
 
 		 438 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 		 378 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.3 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 283 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.64 
 
 		 351 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  28.4 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 		 353 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.36 
 
 		 369 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 283 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 		 407 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  30.88 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 544 aa  87  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 425 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 		 285 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.03 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  25.42 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.09 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  24.12 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.91 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.4 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  26.83 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  31.79 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  30.54 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  28.64 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 		 412 aa  79  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  24.46 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.93 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  27.83 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  25.96 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  31.03 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  24.88 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  29.03 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.32 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  28.23 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  30.97 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  24.54 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  29.11 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  27.05 
 
 		 912 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  26.38 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  25.81 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  31.96 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.48 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.97 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  28.64 
 
 		 465 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  27.05 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  25.48 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  28.38 
 
 		 469 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  25.85 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  25.32 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  28.83 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.52 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  24.9 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>