189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1609 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  100 
 
 		 319 aa  648    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  52.4 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  52.08 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  52.4 
 
 		 318 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  51.76 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  48.57 
 
 		 316 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  49.2 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  49.52 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  48.75 
 
 		 370 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  47.27 
 
 		 314 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  51.13 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  48.4 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  49.36 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  47.59 
 
 		 323 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  49.68 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  46.95 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  46.28 
 
 		 316 aa  292  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  46.15 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  45.83 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  46.5 
 
 		 315 aa  285  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  45.05 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  46.18 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  45.05 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  44.17 
 
 		 324 aa  278  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  44.87 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  45.71 
 
 		 335 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  44.73 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  43.27 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  45.54 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  45.83 
 
 		 321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  49.68 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  41.16 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  44.05 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  42.27 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  42.27 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  48.08 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  42.59 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  48.23 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  41.64 
 
 		 317 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  41.88 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  42.77 
 
 		 320 aa  258  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  41.88 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  41.88 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  41.88 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  41.88 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  44.06 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  45.62 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  46.35 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  41.8 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  39.94 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  41.07 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  42.12 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  42.5 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  40.38 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  47.3 
 
 		 317 aa  248  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  38.66 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  43.13 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  39.68 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  45.51 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  41.8 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  43.17 
 
 		 317 aa  241  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  43.95 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  36.27 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  42.86 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  42.68 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  42.68 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  42.54 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  42.54 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  42.54 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  42.54 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  40.06 
 
 		 314 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  39.81 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  42.86 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  40.38 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  36.08 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  39.12 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  39.87 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  35.28 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  35.69 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  37.42 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  32.26 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  30.29 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  31.94 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  31.94 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  31.94 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  32.58 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  32.58 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  32.58 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  31.94 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  31.94 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  32.47 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  32.69 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  32.48 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  33.02 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  29.64 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  34.38 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  28.43 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0852  hypothetical protein  48.48 
 
 		 186 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0139574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>