52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0260 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1038    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  40.91 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.31 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  41.77 
 
 		 668 aa  57.4  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  34.04 
 
 		 695 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  24.07 
 
 		 597 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1021 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.41 
 
 		 342 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1075 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1147 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  26.94 
 
 		 340 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  32.14 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  34.48 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  37.08 
 
 		 902 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  35.35 
 
 		 741 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.1 
 
 		 630 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  34.83 
 
 		 676 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  39.77 
 
 		 525 aa  50.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1060 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1162 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 757 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  31.35 
 
 		 608 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  24.15 
 
 		 897 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.94 
 
 		 1092 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1043 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.17 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 931 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1220 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  35.58 
 
 		 763 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  23.32 
 
 		 1084 aa  47.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3207  hypothetical protein  26.59 
 
 		 513 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00101679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  25.4 
 
 		 331 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.73 
 
 		 1041 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  45.45 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  30.19 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  29.25 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  24.83 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1090 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26.64 
 
 		 780 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  22.79 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  28.97 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  32.18 
 
 		 679 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1026 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  31.43 
 
 		 997 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1044 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1054 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.31 
 
 		 369 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  25.13 
 
 		 363 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  27.64 
 
 		 1397 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  29.55 
 
 		 520 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  36.36 
 
 		 554 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>