More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0111 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  100 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  61.95 
 
 		 301 aa  345  6e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  56.12 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  57.25 
 
 		 290 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  52.11 
 
 		 293 aa  318  7.999999999999999e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  60.42 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  54.64 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  47.92 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  45.42 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  44.98 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  45.99 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  40.42 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  51.37 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  45.1 
 
 		 291 aa  238  6.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  41.69 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  45.45 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  46.05 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  45.39 
 
 		 301 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  41.41 
 
 		 347 aa  188  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  39.46 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  39.93 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.7 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.7 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  31.83 
 
 		 764 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  30.74 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.68 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.37 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  32.59 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  31.82 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  30.3 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.71 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  30.15 
 
 		 322 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.91 
 
 		 342 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  35.98 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.47 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  32.62 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.1 
 
 		 312 aa  95.9  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.58 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.91 
 
 		 383 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.46 
 
 		 408 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.05 
 
 		 396 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.45 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.43 
 
 		 410 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.45 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  28.85 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  27.34 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.59 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  28.38 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  29.2 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  29.37 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.83 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  28.17 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.74 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.54 
 
 		 352 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  27.14 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.36 
 
 		 406 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0003  glucokinase  33.23 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000615827  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  31.73 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  35.81 
 
 		 398 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  27.22 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.95 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.3 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  29.65 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  30.03 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  28.68 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  26.85 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  27.24 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  32.41 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  26.85 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  32.52 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  32.52 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  32.52 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  31.68 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  30.9 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  28.03 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.51 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.41 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  34.65 
 
 		 363 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  33.71 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.91 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.75 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  31.92 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.13 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.16 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  28.46 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  26.85 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  25.47 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  29.68 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  27.31 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  31.05 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  30.06 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  26.06 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  31.07 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  33.48 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  27.72 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.34 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  31.8 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.67 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  30.47 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  29.37 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>