204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6667 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 165 aa  330  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  90.91 
 
 		 165 aa  289  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  80.13 
 
 		 163 aa  253  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  80.65 
 
 		 164 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  63.76 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  59.33 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  49.31 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  47.02 
 
 		 152 aa  150  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  53.02 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  54.48 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  49.37 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  52.08 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  52.05 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  48.1 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  47.59 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  47.65 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  47.65 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  48.98 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  46.53 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  46.53 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 155 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  41.83 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  45.52 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1027  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190417  normal  0.406014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  50.69 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  49.31 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  47.3 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  47.97 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  46.58 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  43.06 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  43.92 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  43.45 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  43.92 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  43.92 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  44.06 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  43.92 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  43.45 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  40.69 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 157 aa  117  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  43.92 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  45.14 
 
 		 151 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  42.28 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  48.57 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  48.57 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  48.57 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7184  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>